!!! Если есть возможность, обратитесь к профессиональному системному администратору !!!
Лучше оставить на несколько часов или целый день, может обновится.
Если не обновилось:
sudo dpkg --configure -a
Если apt еще выполняется, dpkg не выполнится, а укажет какой процесс убить. Убиваем:
kill 345654
и снова:
sudo dpkg --configure -a
Если ни рут, ни панель управления не работает, как было у меня, то перезагружаем сервер и делаем, то что описано выше.