Если у Вас хостинг, то обратитесь к хостеру — должны помочь.
Если VPS или выделенный сервер, то в терминале набираем:
php --ini
И смотрим чтобы XXX модуль не был задвоен. Допустим, у меня было два файла: 40-zip.ini и zip.ini Я удалил zip.ini и ошибка пропала.